Вселенная внутри нас. Как микробы обогащают наш взгляд на жизнь - Эд Йонг

гены в одну из клеток вашего кишечника, эти гены исчезнут, как только клетка погибнет. Такой ген может стать частью генома отдельного человека, но частью человеческого генома в целом – нет. В 2013 году Даннинг-Хотопп выяснила, что такие кратковременные союзы образуются на удивление часто (Riley et al., 2013). Она провела анализ не одной сотни геномов человека, взятых из соматических, не участвующих в размножении клеток – например, клеток почек, кожи или печени. Примерно в трети этих клеток она обнаружила ДНК бактерий. Особенно много ее нашлось в раковых клетках – интригующий результат, хотя пока неясно, что он означает. Возможно, опухоли более всего подвержены генным вторжениям, а может, это гены бактерий задействованы в преобразовании клеток из здоровых в раковые.

323

Danchin, Rosso, 2012; Danchin et al., 2010.

324

Acuna et al., 2012.

325

В исследовании также принимали участие еще несколько ученых – среди них Жан-Мишель Дрезен, Майкл Стрэнд и Гэлен Берк: Bezier et al., 2009; Herniou et al., 2013; Strand, Burke, 2012.

326

Вообще говоря, это случилось дважды. Еще одна группа наездников – ихневмониды – независимо от браконид приручили другой тип вирусов и теперь пользуются ими почти так же, как бракониды браковирусами (Strand, Burke, 2012).

327

Сет Борденстайн обнаружил, что нечто похожее на историю с геном tae (Chou et al., 2014) произошло и с другим антибиотическим геном, решившим сменить биологическое царство (Metcalf et al., 2014).

328

Существует еще один пример подобной системы: бактерия умудрилась пробраться прямо в митохондрии клещей и так там и осталась. Ей дали название Midichloria – в честь ненавистных многим симбионтов вселенной «Звездных войн», дающих хозяевам возможность использовать Силу.

329

Маккатчен объявил таких недомикробов «головоломками биологической классификации» (McCutcheon, 2013). Они, разумеется, все еще бактерии, и геномы у них свои, отдельные. Однако по отдельности они выжить не могут, а иные (например, Moranella) не могут даже определиться с собственными границами. Некоторые из них практически стали чем-то вроде митохондрий и хлоропластов – такие структуры называются органеллами. Маккатчен считает, что органелла – это последняя стадия симбиоза, кульминация долгого процесса утраты и перемещения генов, в результате которого у животного и бактерий не остается иного выбора, кроме как объединиться.

330

Husnik et al., 2013.

331

Вы, возможно, вспомните, что пептидогликан – это один из MAMP, регулирующих развитие гавайской эупримны.

332

И это еще не все! У других видов червецов на смену Moranella пришли другие симбионты (Husnik, McCutcheon, 2016). Все они, как и Moranella, являются родичами HS – бактерии, что попала в руку Томасу Фрицу и затем была идентифицирована Колином Дейлом.

333

Также они сотрудничали с Молли Хантер, экспертом по паразитоидам.

334

Hamiltonella названа в честь Билла Хэмилтона, легендарного специалиста по эволюционной биологии, у которого училась Моран.

335

Открытие Hamiltonella: Oliver et al., 2005; открытие фага в ее организме: Moran et al., 2005; неустойчивость симбиоза тли и Hamiltonella: Oliver et al., 2008.

336

Moran, Dunbar, 2006.

337

Jiggins, Hurst, 2009.

338

Исследованием японского клопа руководил гуру симбиоза Такема Фукацу (Kikuchi et al., 2012); второстепенные симбионты тлей: Russell et al., 2013b; успешное сотрудничество тлей с второстепенными симбионтами: Henry et al., 2013.

339

О роли бактерии Spiroplasma в успехе плодовых мушек: Jaenike et al., 2010; быстрое распространение симбионта: Cockburn et al., 2013.

340

Это обнаружила Молли Хантер (Himler et al., 2011).

341

Возможно, они и союзы будущего смогут предсказывать. Несколько лет назад Дженайк выяснил, что Spiroplasma защищает представителей нескольких видов мушек. У одного из этих видов бактерий-защитников нет, хотя нематоды также лишают представителей этого вида способности размножаться. Дженайк искусственно ввел им Spiroplasma – они снова начали откладывать жизнеспособные яйца (Haselkorn et al., 2013). Эти двое почему-то до сих пор не заключили союз в природных условиях, однако мушке он крайне полезен, а значит, рано или поздно договор будет подписан.

342

Обзор, посвященный филярийным инфекциям и вызывающим их нематодам – переносчикам вольбахии: Taylor et al., 2010; Slatko et al., 2010.

343

Структуры, напоминающие бактерий, в организмах филярийных нематод: Kozek, 1977; Mclaren et al., 1975; идентификация вольбахии: Taylor, Hoerauf; 1999.

344

Hoerauf et al., 2000, 2001; Taylor et al., 2005.

345

У доксициклина есть и другие преимущества. В некоторых регионах Центральной Африки онхоцеркоз лечить крайне сложно: в организме больных, как правило, обитает еще одна филярийная нематода – Loa loa, известная как глазной червь. Если убить вид, вызывающий онхоцеркоз, обычным препаратом, глазной червь тоже погибнет, вот только их личинки настолько крупные, что после гибели могут заблокировать кровеносные сосуды и привести к поражению головного мозга. Глазной червь не является переносчиком вольбахии, так что доксициклин ему не вредит. Он устраняет причину онхоцеркоза без тяжелых побочных последствий.

346

Стратегия консорциума A·WOL: Johnston et al., 2014; Taylor et al., 2014. Лабораторные опыты с миноциклином: Sharma et al., 2016; исследование в Гане: Klarmann-Schulz et al., 2017; данные из Камеруна еще не опубликованы.

347

Voronin et al., 2012.

348

Rosebury, 1962, с. 352.

349

Сокращение численности земноводных: Hof et al., 2011; исследование Bd: Kilpatrick et al., 2010; Amphibian Arc, 2012.

350

Eskew, Todd, 2013; Martel et al., 2013.

351

Harris et al., 2006.

352

Об открытии популяции лягушек в озере у горы Коннесс: Woodhams et al., 2007; J-liv защищает от Bd в лабораторных условиях: Harris et al., 2009. На момент написания