Вселенная внутри нас. Как микробы обогащают наш взгляд на жизнь - Эд Йонг

182

Американский сатирик Стивен Кольбер, рассказывая в своем шоу об этом эксперименте с вирусами, поинтересовался: «А кораллы-то эту дрянь от кого подцепили?» («Who has been fucking the corals?»).

183

Бывают у кораллов и болезни, вызванные одним микробом. «Белая чума», например, результат трудов Serratia marcescens – бактерии, обитающей в почве и канализационных отходах. Однако это скорее исключение, чем правило.

184

Обзоры понятия «дисбиоз»: Bäckhed et al., 2012; Blumberg, Powrie, 2012; Cho, Blaser, 2012; Dethlefsen et al., 2007; Ley et al., 2006. Этот термин нередко приписывают русскому ученому Илье Мечникову, но о дисбиозе говорили и за несколько десятилетий до него.

185

С некоторыми учеными, работавшими с Гордоном, мы встречаемся в этой книге, в том числе с Джастином Зонненбергом, Рут Лей, Лорой Хупер и Джоном Ролзом. С Робом Найтом они уже давно сотрудничают. Саркис Мазманян утверждает, что занялся исследованиями в области микробиологии благодаря статье, написанной Гордоном в 2001 году, «еще до того, как микробиом стал микробиомом».

186

Этой комнатой заправляют Дэвид О’Доннелл и Мария Карлссон, работающие с Гордоном с 1989 года, и Джастин Серуго, беженец из Демократической Республики Конго, устроившийся в университет уборщиком и позже присоединившийся к команде. Спасибо, что показали и рассказали все, ребята.

187

Микробиолог Джеймс Рейнирс и инженер Филип Трекслер разработали способы массового производства стерильных мышей в 1940-х (Kirk, 2012). Они извлекали матки беременных самок, обрабатывали их дезинфекционным раствором, помещали в изолированные камеры, вырезали зародышей и выращивали их вручную. Так они разводили стерильных мышей, крыс и морских свинок, а потом смогли заняться свиньями, котами, собаками и даже обезьянами. Методика, безусловно, эффективная, однако первые стальные камеры с массивными рукавицами и крошечными окошками были неудобными и жутко дорогими. К 1957 году Трекслер создал пластмассовую камеру с резиновыми перчатками, почти как в лаборатории Гордона. Работать с такими камерами оказалось куда проще, да и стоили они в десять раз меньше.

188

Bäckhed et al., 2004.

189

О связи микробиома и ожирения: Zhao, 2013; Harley, Karp, 2012. Первым исследованием, в котором было доказано, что микробы в кишечнике страдающих ожирением людей и мышей отличаются от нормальных, руководила Рут Лей (Ley et al., 2005), а Питер Тернбо провел серию опытов по пересадке кишечных микробов людей с ожирением в кишечник стерильных мышей (Turnbaugh et al., 2006).

190

Патрис Кани руководил работой с Akkermansia вместе с Виллемом де Восом, открывшим эту бактерию (Everard et al., 2013). Ли Каплан руководил исследованием, посвященным операции желудочного шунтирования (Liou et al., 2013).

191

Ridaura et al., 2013.

192

Исследованием руководили Мишель Смит и Таня Яцуненко. В нем также принимали участие Марк Мэнари и Инди Трехан (Smith et al., 2013a).

193

Как выразился великий эколог Боб Пейн, «значительные отклонения от нормы приводят к экологическим сюрпризам». Он имел в виду национальные парки, острова и устья рек. То же самое он мог бы сказать о нашем организме (Paine et al., 1998).

194

О взаимосвязи микробиома и иммунитета: Belkaid, Hand, 2014; Honda, Littman, 2012; Round, Mazmanian, 2009.

195

О связи воспалительных заболеваний кишечника с микробиомом написана не одна сотня статей. Я рекомендую к прочтению обзоры, подготовленные передовыми специалистами в этой области: Dalal, Chang, 2014; Huttenhower et al., 2014; Manichanh et al., 2012; Shanahan, 2012; Wlodarska et al., 2015. Также стоит взглянуть на серию проведенных Венди Гарретт исследований, посвященных влиянию иммунитета на микробиом (Garrett et al., 2007, 2010), и на статьи об изменениях в микробиоме, происходящих при воспалительных заболеваниях кишечника: Morgan et al., 2012; Ott et al., 2004; Sokol et al., 2008.

196

Из исследований, посвященных связи микробиома с воспалительными заболеваниями кишечника, одно из самых масштабных было проведено под руководством Дирка Геверса (Gevers et al., 2014).

197

Cadwell et al., 2010.

198

Berer et al., 2011; Blumberg, Powrie, 2012; Fujimura, Lynch, 2015; Kostic et al., 2015; Wu et al., 2015.

199

Hay fever, hygiene, and household size. Все элементы перечисления в названии статьи начинаются с буквы «h». «Среднее «h» было ключевым, – пишет Эд Йонг. – Оно подарило идее имя: hygiene hypothesis». – Прим. ред.

200

Gerrard et al., 1976; Strachan, 1989. Иногда Стракана ошибочно считают отцом гигиенической гипотезы, однако сам он отрицает, что породил на свет такой enfant terrible, приводит цитаты мыслителей, использовавших этот термин до него, и утверждает, что подбирал слова, «руководствуясь скорее склонностью к аллитерации, чем стремлением создать новую научную парадигму» (Strachan, 2015).

201

Arriera et al., 2015; Brown et al., 2013; Stefka et al., 2014.

202

«Старыми друзьями» их впервые назвал Грэм Рук (Rook et al., 2013).

203

Fujimura et al., 2014. Возможно, разница обусловлена тем, что собаки крупнее кошек и чаще бывают на улице.

204

Dominguez-Bello et al., 2010. Эпидемиологические исследования, указывающие на связь кесарева сечения и болезней, возникающих позже: Darmasseelane et al., 2014; Huang et al., 2015.

205

На влияние насыщенных жиров указал Юджин Чан (Devkota et al., 2012). Эндрю Гевиртц исследовал пищевые добавки (Chassaing et al., 2015).

206

О приключениях Беркитта: Altman, 1993. Его рассуждения о клетчатке цитируются здесь: Sonnenburg, Sonnenburg, 2015, с. 119.

207

Венди Гарретт и другие ученые показали, что расщепляющие клетчатку бактерии производят короткоцепочечные жирные кислоты (Furusawa et al., 2013; Smith et al., 2013b). Манеш Десай выяснил, что за неимением клетчатки кишечные бактерии принимаются за слизистый слой (Desai et al., 2016).

208

Джастин и Эрика Зонненберг доказали, что от недостатка клетчатки некоторые микробы в кишечнике вымирают